První
muzea v moderním slova smyslu vznikala na našem území
od počátku 19. století, nejprve v zemských metropolích, v průběhu století i v dalších větších městech. V první polovině roku 1877 ustavili
zámožní budějovičtí měšťané Musejní spolek a městská rada schválila stanovy nového městského muzea. Muzeum řídil správní výbor, v němž zasedaly významné osobnosti zdejšího politického, hospodářského a kulturně-společenského života. Muzeum
sídlilo nejprve v domě č. p. 16 na
náměstí, později se sbírky přestěhovaly do domu U Tří korun vedle radnice, kde byly zpřístupněny veřejnosti. Základem původního sbírkového fondu se staly
dokumenty a historické památky uložené původně na radnici,
dary předních měšťanských rodin i budějovických rodáků pobývajících v cizině, podstatnou část fondu tvoří
archeologické nálezy z výzkumu mohyl v Plavu.
Roku
1888 se
muzeum rozdělilo na dvě části,
Průmyslové muzeum s kreslírnou a modelovnou a
Přírodovědné a uměleckoprůmyslové muzeum, v jejichž čele stáli samostatní kustodi. Příliv sbírkových předmětů v 90. letech 19. století si vynutil
výstavbu moderní novorenesanční budovy, která byla slavnostně otevřena 11. 7. 1903. V roce 1927 muzeum převzalo sbírky Diecézního musea a o rok později vznikla při muzeu Vlastivědná společnost historická.
Za okupace byli čeští zaměstnanci propuštěni, stálé expozice zrušeny a výstavní
sály přeměněny na skladiště. Expozice se
znovu otevřely veřejnosti roku 1947. V 50. a 60. letech teď už Krajské vlastivědné muzeum přebíralo sbírkové fondy ze zrušených městských muzeí v
Horní Plané,
Trhových Svinech, Lišově či
Třeboni, vznikaly nové stálé
expozice přírodních věd a historie a na
tvrzi Žumberk u Nových Hradů vznikla expozice
jihočeského lidového nábytku. Od roku 1979 převzalo Jihočeské muzeum do správy
strážní domek koněspřežní železnice v Mánesově ulici, který byl po rekonstrukci v roce 1992 zpřístupněn veřejnosti.
Ve správě muzea se v současné době nalézá kolem
800 000 sbírkových předmětů z oboru přírodních a společenských věd, pracuje zde celá řada specializovaných klubů a kroužků a instituce vydává pravidelně čtyři odborné časopisy. Expozici lze navštívit až
do 29. října 2017 denně (kromě pondělí), včetně svátků
od 9:00 do 17:30. Vstupné pro dospělé vyjde na 25 Kč, snížené stojí 15 Kč a rodinné 55 Kč.