Presbytář prostupoval interiérem zahradního domku a zdivo lodi sahalo až před dnešní východní křídlo
zámku. Kostel sv. Alžběty byl z písemných pramenů nepřímo znám z počátku 16. století. Zánik kostela byl tragický, došlo k němu při požáru v roce 1788.
Archeologický výzkum potvrdil využívání kostela jako místa posledního odpočinku majitelů
jilemnického panství i v pozdějších dobách. Kupříkladu se nalezl relikt zděné hrobky, kam byli postupně uloženi syn a vnuk Kryštofa Haranta z Polžic a
Bezdružic.