Národní muzeum spravuje historický knižní fond, zámecké knihovny, odbornou veřejnou knihovnu a archiv zvláštního významu. Sbírkové předměty jsou prezentovány prostřednictvím stálých expozic, ale i krátkodobých výstav, dále pak vlastní publikační a přednáškovou činností. Muzeum provádí vědecký výzkum, vykonává pedagogickou činnost, pořádá kulturní a vzdělávací programy, vydává publikace, audio a videonahrávky.
Národní muzeum tvoří pět odborných ústavů:
Přírodovědecké muzeum, Knihovna Národního muzea, Historické muzeum, Náprstkovo muzeum asijských, afrických a amerických kultur, České muzeum hudby.
Historická budova Národního muzea je od 8. 7. 2011 uzavřena z důvodu rekonstrukce.
Kromě sbírek v hlavní budově na Václavském náměstí pod Národní muzeum spadají také tyto expozice:
- Náprstkovo muzeum asijských, afrických a amerických kultur (Betlémské náměstí, Praha)
- České muzeum hudby (Karmelitská ulice, Praha)
- Muzeum Bedřicha Smetany (Novotného lávka, Praha)
- Muzeum Antonína Dvořáka (Ke Karlovu, Praha)
- Lapidárium (Výstaviště, Praha)
- Nová budova NM (bývalá budova rádia Svobodná Evropa, Vinohradská ulice)
- Národopisné muzeum - Musaion (Letohrádek Kinských, Praha)
- Národní památník na Vítkově (ul. U Památníku, Praha)
- Památník Jaroslava Ježka (Modrý pokoj - Kaprova ulice, Praha)
- Památník Františka Palackého a Františka Ladislava Riegra (Palackého ulice, Praha)
- Muzeum české loutky a cirkusu (Prachatice)
- Muzeum knihy (Žďár nad Sázavou)
- Památník Antonína Dvořáka (Nelahozeves)
- Památník Bedřicha Smetany (Jabkenice)
- Památník Josefa Suka (Křečovice)
- Zámek Vrchotovy Janovice
- Expozice Národního muzea na státním zámku Litomyšl (Státní zámek Litomyšl)
Z historie muzea: muzeum bylo založeno roku 1818 pod názvem Vlastenecké muzeum v Čechách. Od roku 1848 neslo název České muzeum, v období let 1854–1919 pak Muzeum Království českého. Před postavením nové budovy muzeum sídlilo provizorně ve Šternberském (1821–1846) a Nostickém paláci (1846–1892). Václavskému náměstí dominuje budova Národního muzea. Postavena v letech 1885-90 podle plánů arch. Josefa Schulze a je typickou ukázkou české novorenesance, inspirované vzory francouzského klasicismu.