Trať je pravidelně udržována frézovou rolbou a na každém rozcestí naleznete orientační tabule a rozcestníky. Jizerská magistrála v centrální části Jizerských hor patří k nejnavštěvovanějších areálům pro běh na lyžích v ČR a je známá pravidelnou strojovou úpravou bežeckých stop o celkové dálce přes 150 km, o kterou se stará Jizerská o.p.s.
Největším nástupním místem Jizerské magistrály je Bedřichov, dalšími nástupními místy jsou pak např. Smědava, Jizerka, Horní Polubný, přehrada Souš či Hrabětice.
V oblasti Jizerské magistrály se každoročně v lednu koná nejznámější český lyžařský závod Jizerská 50 se startem a cílem v Bedřichově.
Již před sto lety bylo území české části Euroregionu Nisa považováno za turistický ráj, do kterého kvůli odpočinku a poznání přijížděli návštěvníci nejen z celých Čech, přilehlých oblastí Horní Lužice, Dolního Slezska, ale i z Prahy, Drážďan či Berlína. A právě zde vznikla na samém počátku 20. století nejslavnější a nejdelší hřebenová cesta – Modrá Hřebenovka - spojující jednotlivé horské hřebeny. V době své největší slávy propojovala nejvýchodnější cípy Krušných hor s vrcholem Praděd , přičemž vedla přes Labské pískovce, Lužické a Jizerské hory, Krkonoše, Orlické hory a Jeseníky. Jizerská část hřebenovky – dnes nazývaná Jizerská magistrála pro pěší turistiku – byla jednou z prvních a nejoblíbenějších částí této slavné trasy. Magistrála se myšlenkou svého vzniku vrací do oněch nadšených let na počátku 20. století, proto je určena výhradně pro pěší turisty.