Přírodní rezervace Mokřady horní Liběchovky je součástí území „Mokřady Liběchovky a Pšovky“ začleněného do seznamu mezinárodně významných mokřadů podle Ramsarské úmluvy o ochraně mokřadů mezinárodního významu.
Rezervace zahrnuje rozsáhlý komplex mokřadů různých typů. Prameniště, slatiny, ostřicové mokřady, vlhké louky, vodní toky.
Z ohrožených rostlin zde roste například kruštík bahenní, upolín nejvyšší, přeslička největší, prstnatec májový, v korytě protékající Liběchovky i vzácná ruducha (červená řasa).
Z řady vzácných druhů plžů se zde objevuje například vrkoč bažinný, vrkoč útlý a oblovka velká. V údolí Křenovského potoka žije populace mloka skvrnitého, který je v
CHKO Kokořínsko-Máchův kraj velmi vzácný.
Ke zlepšení podmínek pro cenná společenstva rostlin a živočichů se na vybraných vhodných plochách provádí kosení, odstraňování náletu dřevin, obnova a tvorba drobných vodních ploch, eventuálně odbahňování rybníků.