Nedaleko kostelíku byly vystavěny
lázně, kde se uzdravilo mnoho lidí, především vojáků z
30leté války. V roce 1811 daroval jeden
jindřichohradecký měšťan kostelíku za své uzdravení
obraz madony, který zde visel do roku 1895. Nyní je v
Národní galerii v Praze v
Anežském klášteře s názvem
Assumpta z Deštné.
Kostelík býval díky léčivému prameni poutním místem, které
o svátku sv. Jana Křtitel navštěvovalo
až 8 000 poutníků. Svatojánská pouť se v
Deštné drží dodnes.
V kostelíku jsou obrazy deštěnského faráře P. Bedřicha Kamarýta, z nichž pro deštnou nejvýznamnější, zobrazující
pověst o nalezení svatojánského pramene, je umístěn nad vchodem. Kostelík byl opravován roku 1951 (pořízena kopie věžičky, která hrozila zřícením), v roce 1968 a naposledy v letech 1996 – 97 (střecha a fasáda).