Astronomická činnost se datuje od roku 1948, kdy byla na školní budově na Husově náměstí zřízena astronomická pozorovatelna. Návštěvy byly tehdy tak masivní, že v roce 1955 započala výstavba nové hvězdárny.
Od roku 1973 se na hvězdárně měří, archivují a vyhodnocují základní meteorologické hodnoty: teplota, tlak, vlhkost, sluneční svit a dešťové srážky.
Od listopadu 2014 je na hvězdárně staro-nový dalekohled, kterým bude možné pozorovat galaxie, mlhoviny a hvězdokupy novým dalekohledem. Do Prostějova se vrátil z Vyškova zhruba po půl století. Dalekohled je speciální v tom, že má tubus otočný kolem své osy. Přístroj je však potřeba nejprve osadit optikou, provést jeho údržbu, vyčistit, seřídit a rozběhnout počítačový systém.