První písemné zmínky o pivovaru pochází z přelomu 16. století, kdy pivovar spolu s celým Kounickým panstvím směnil Prokop Dvořecký z Olbramovic s Janem Rudolfem Trčkou. Pivovar pravděpodobně vznikl již dříve za Joachyma Wachtla z Pantenova, za jehož držení Kounice i celé panství velice rozkvetlo. V dalším období byl pivovar často pronajímán různým nájemcům. V 18. století dosahoval výstav Kounického pivovaru ročně až 1300 hektolitrů piva. Místní název pole „Na chmelnici“ dokumentuje i pěstování chmele pro pivovar.

Po dlouhé roky byl pivovar pronajímán, až roku 1884, kdy ho odkoupili Antonín a František Klusáčkové, kteří následujícího roku založili „továrnu na výrobu sladu“. Sladovna pod vedením rodiny Klusáčků fungovala až do znárodnění v roce 1948. Následně byl provoz zachován a podnik byl začleněn pod Obchodní sladovny Praha n.p. Roku 1992 byla sladovna navrácena v restituci rodině Klusáčků.

Dnes je zde sládkem Jaroslav Košťák, který vařil pivo i v takových pivovarech jako jsou Svijany či ve Velkých Popovicích. V době otevření počítal pivovar s výstavem 400 až 700 hektolitrů piva. Nyní nabízí pivovar čtyři druhy piva: Světlý ležák 12%, Ginger Ale 12% (do kterého je speciálně přidáván strouhaný zázvor), Polaris 15% (německá odrůda chmele), IPA 17% a další speciální piva jako je Bylinkové, Pšeničné nebo třeba English Porter. Nebojí se experimentovat s druhy chmele z celého světa, a tak vznikly i speciály jako je Melon (německý s melounovo-jahodovým profilem aromatu), Sorachi Ace (japonsko-americký chmel) či Nelson Sauvin (novozélandský).