Farní a poutní kostel v obci Svatý Tomáš je
cennou stavební památkou.
Postaven byl roku
1348 na příkaz
Petra I. z Rožmberka. Sakristie na severní straně kostela je ovšem starší. Je románská a pochází údajně z kostela, který dal zbudovat roku 1258 Vítek z Krumlova.
Po druhé světové válce byl
Svatý Tomáš – stejně jako mnoho okolních obcí –
vysídlen a v letech 1956–1958 byla
zbořena většina domů, které nahradily nevzhledné komunistické bytovky, určené pro zaměstanance lesního závodu, důstojníky a mužstvo radarové stanice, jejíž pozorovatelna byla zřízena na věži
Vítkova Kamene.