Původní románský kostel s prvky gotiky, založený Johanity při špitále, byl v 17. stol. předán piaristickému řádu, který přišel do města v roce 1687 a založil tu gymnázium, kolej a pěvecký seminář. Piaristé přistavěli ke kostelu svou kolej a v roce 1737 začali se stavbou nového chrámu podle projektu biskupského architekta Cyraniho z Bolleshausu. Chrám byl vysvěcen v roce 1768. K připomínce této události slouží 12 bronzových křížů umístěných kolem obvodu kostela.

Projekt vycházel z půdorysu vídeňského chrámu salesiánek na Renngasse, fasáda připomíná vzory vídeňských a pražských chrámů. Nad vchodem je umístěno sousoší Kristova křtu s adorujícími anděly. Vynikající interiér ozdobený rokokovými prvky je dílem předních umělců Moravy a Rakouska. Svou polohou a svými rozměry (21 m délky, 15,8 m v šířky) představuje dominantu v kroměřížské centrální části města, která je vstupní částí do historického jádra.