Krabonoš na Třeboňsku leží pouhých 1,5 km od česko-rakouské státní hranice, a proto byl roku 1950 začleněn do vojenského pohraničního pásma. Následné vysídlení a zbourání téměř všech objektů vyvrcholilo zalesněním celého území. Z mapy vymizel i název vesnice, protože byla sloučena se sousední Novou Vsí nad Lužnicí. Jediným pozůstatkem původní zástavby vesnice ulicovitého typu, vinoucí se podél řeky Lužnice, zůstal farní kostel zasvěcený svatému Janu Křtiteli, s farou.

Kostel byl založen patrně již ve 13. století a od roku 1419 je uváděn jako farní. Jeho stáří dokládá i dodnes zachovaný transfer středověké omítky s fragmentem malby sv. Jana Křtitele. Fara přiléhající ke kostelu má patrně pozdně gotický původ. Současnou klasicistní podobu dostala zřejmě po požáru roku 1807. Budova přestála i další požáry v letech 1860 a 1876 a dokonce obě světové války. Osudným se této stavbě stal rok 1954, kdy se ve velmi dobrém stavebním stavu dostala do rukou příslušníků pohraničního útvaru, kteří ji nechali chátrat.

V roce 2014 farnost spadla pod správu Třeboně. Od té doby došlo k mírným úpravám interiéru a občas se v kostele koná bohoslužba; poutní mše se každoročně pořádá na svátek patrona tohoto kostela, svatého Jana Křtitele. V roce 2025 na místě proběhl archeologicko-historický průzkum, následovat mají klíčové stavební práce: statické zajištění konstrukce, oprava střechy i revitalizace interiéru. Římskokatolická farnost České Velenice zřídila transparentní účet, kam mohou dárci přispívat na záchranu tohoto kostela.