Areál botanické zahrady se rozkládá v Trojské kotlině na rozloze cca 70 ha. V zahradě se nachází také tropický skleník vybavený nejmodernějšími technologiemi
Fata Morgana, historická
vinice sv. Kláry i meditační
Japonská zahrada, celkově téměř 30 ha upravených expozičních ploch.
I v zimních měsících si zájemci mohou užít krásnou procházku v botanické zahradě v Troji. Když napadne sníh, je to ta pravá romantika. Zpod bílé pokrývky vykukují větve jehličnanů a stálezelených stromů a keřů a nejrůznější barevné akcenty, například červené, oranžové i žluté plody cesmíny, hlohyně, dřišťálu, růží nebo do fialova zbarvené krásnoplodky. I pod sněhem je možné najít některé květy, například vilínů nebo jasmínu nahokvětého, který mimo jiné zdobí i expozici Japonské zahrady. Ta má své osobité kouzlo v každém ročním období, zimu nevyjímaje. Sněhový poprašek a námraza ještě více podtrhnou klid, který zde panuje. V areálu botanické zahrady najdete rovněž řadu stálezelených trvalek, které i v zimě zdobí zahrady, obzvlášť když padne jinovatka.
V expozici Severoamerické polopouště v zimě překvapí rostliny, které známe spíše z teplých krajin – zimovzdorné kaktusy, juky a další sukulenty.
Pokud se návštěvníci chtějí trochu zahřát, mohou zavítat do vinotéky na vinici sv. Kláry a u krbu si vypít hrnek svařeného vína nebo horkého moštu. Vinotéka je otevřená ve všední dny od 13 do 17 hodin a o víkendu od 11 hodin. Na Štědrý den pak bude otevřeno pouze do 15 hodin a na Silvestra a Nový rok bude vinotéka uzavřena.