Zadní synagoga byla postavena v roce 1669 v renesančním slohu, kdy rostoucímu počtu obyvatel již přestala stačit starší tzv. přední synagoga. Vnitřní výmalba pochází z let 1705 - 1707 a zobrazuje oblohu posetou hvězdami a západ slunce. Na stěnách pak návštěvník uvidí židovské liturgické texty doplněné florescentními motivy.
Na ženské galerii se nachází expozice vztahující se k židovským tradicím a zvyklostem. Dále zde návštěvník může obdivovat model židovského města. Model zobrazuje skutečný stav ghetta k roku 1850. Model je interaktivní a kromě češtiny hovoří pěti dalšími jazyky.